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04-24 2023

实用篇|荧光定量PCR问题疑难解答<第五期>

发布者:本网站 浏览次数:736

上期我们为大家分享了“荧光定量PCRSGCT的问题本期我们继续来挖掘实验中的出现的异常问题。

一、荧光定量污染解决办法

1. 配反应体系和加模板要在不同的屋子进行;

2. 配体系的屋子准备一件干净的白大衣,要注意的是每次进去都要记得换白大衣,至少要把别的屋子穿的白大衣脱掉;

3. 分装好体系以后把反应板/条放在一个有盖的干净的托盘中端到加样的房间;

4. 配体系戴的手套可以带到加样的房间,反过来不可;

5. PCR完毕后,反应产物拿到别的屋子扔掉;

6. 最重要的就是不要把DNA带到配体系的屋子,以上几点也都是为了这一目的。


1-1(扩增效率偏高)

上图中标准曲线最低浓度点被外源DNA污染,导致提前扩增,扩增效率偏高。


1-2(精密度不合格

上图中标准曲线扩增正常,线性相关系数R=1,扩增效率Eff%=98.67,说明实验操作无问题,但孔间精密度偏差较大,为DNA气溶胶污染。


1-3(实验专属不合格

上图中标曲线性相关系数(R≥0.99)及扩增效率(90-105%)均符合要求,但阴性扩增CT值<35,实验专属性不合格。

二、荧光定量real-time PCR重复性问题

建议不要只加1ul,而是稀释10倍左右然后加10ul,这样有助于改善重复性。 如果测的是拷贝数,重复性不好是很难避免的,用SYBR green作real time的误差还是比较大的,它的优势在于灵敏度高,但如果想精确定量,还是比较困难的,只好重复很多次,或者多花钱买标记的引物,那个特异性最好。