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分子标记

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项目介绍

分子标记是基于核酸分子多态性的遗传标记,其直接反应DNA水平的遗传变异。服务分类:SSR分子标记、SNP基因分型、InDel标记等。


简单介绍


SSR(简单重复序列)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1~6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,如:(CA)n和(TG)n,每个微卫星的核心序列结构相同,重复单位数目10~60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。


SNP(单核苷酸多态性)指基因的某个碱基对出现替换缺失或增添而引起的碱基序列发生改变,最终导致DNA序列的多样性,其中某一等位基因的突变频率应大于1%。


InDel是指在近缘种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion-deletion), 是同源序列比对产生空位(gap)的现象。



样本要求


植物样本:叶片采用硅胶干燥后或干冰运输
动物样本:无水乙醇封存低温运输

DNA:浓度为50-100ng/ul,至少15uL,干冰运输





服务流程

可提供结果内容

A、电泳图谱

B、测序结果

C、数据分析结果

D、实验报告

服务内容及周期

服务内容

数量


周期

SSR引物开发

40条特异性引物


30个工作日

基因组DNA提取

≤30个样本

>30个样本



5个工作日

引物合成

<60bp


5个工作日

SSR引物筛选

PCR扩增

PAGE筛选



5个工作日

10个工作日

SSR批量实验

PCR扩增

3730xl测序仪检测



5个工作日

10个工作日